研究者は、分子やポリマーを距離制限でクラスタ化する「幾何学的分割法」を提案した。 この手法はk‑center問題を解く形で、分子を代表原子で切り分け、半径を設定するだけでフラグメント数が決まる。 ポリマーのデータセットで、幾何学的分割と3D構造情報を併用したモデルは、p‑SMILESだけを使ったモデルよりもRMSEが低く、精度が向上した。 3D構造は古典的なフォースフィールドで最適化された単一のコンフォーマーを利用しているが、これは真のエネルギー準位を正確に表現できない可能性がある。 そのため、複数のコンフォーマーを考慮する必要があると論者らは指摘している。